军棋对方的军旗在我的大本营里是不是就算我赢

这要看你是在玩那种类型的军旗。四国军旗，扛旗就赢；现实中的夹旗（跟四国军旗有点类似，3个人玩，两个人对战，一个人做中间人，比大小，这个时候的棋子是竖着的），需要把雷吃完，再把军旗扛回大本营才赢；现实中的翻旗（棋子是盖着的，需要翻过来，分清红黑，再玩，2个人就行了），排完累，再把军旗扛回大本营才赢